Alhamdulillah, setelah berhasil mendapatkan Akreditasi B dari BAN PT pada tahun 2006 sebagai salah satu dari dua perguruan tinggi swasta di Indonesia yang langsung mendapatkannya, di akhir tahun 2009 Fakultas Kedokteran Universitas Islam Indonesia (FKUII) mendapatkan kado istimewa, buah kerja cerdas dan kerja keras seluruh sivitas akademika berupa pemberian sertifikasi