Perpustakaan Fakultas Kedokteran Universitas Islam Indonesia (FK UII) adalah bagian integral dari Direktorat Perpustakaan Universitas Islam Indonesia. Perpustakaan ini dirancang untuk mendukung sistem pembelajaran di Fakultas Kedokteran, yang memiliki karakteristik akademik khusus dengan beban studi yang lebih intensif dan penerapan sistem pembelajaran berbasis blok.
Keberadaan perpustakaan mandiri di Fakultas Kedokteran bertujuan untuk memberikan kemudahan dan kecepatan akses terhadap sumber informasi yang relevan bagi mahasiswa. Dengan koleksi bahan pustaka yang terfokus pada bidang kedokteran, perpustakaan ini berperan penting dalam menunjang proses belajar-mengajar serta mendukung pengembangan kompetensi mahasiswa dalam bidang kesehatan.